V primerih, ko po geokodiranju etaže niso lepo poravnane ena nad drugo (to je načeloma v vseh primerih, ko pri konstrukciji niste delali po principu kopiranja etažnih načrtov), za vertikalno uskladitev etaž v meniju Načrti izberite orodje Poravnava etaž. Etažni načrti se v grafiki obarvajo belo in na ekranu se prikaže pogovorno okno Poravnava etaž.
V seznamu izberite etažo, ki bo predstavljala osnovo, na katero se bodo ostale etaže poravnale, ter kliknite na gumb Referenčna etaža. V vrstici te etaže se izpiše REF in etažni načrt se obarva modro, tako da se loči od ostali etaž. Vse ostale etaže se v seznamu z zeleno kljukico označijo za poravnavo. Izbiro etaž za poravnavo lahko spremenite z desnim klikom na miški v vrstico seznama določene etaže ali z gumboma Izberi vse in Izberi nič.
V grafičnem oknu nato z orodjem za izbiro točk (to orodje se samodejno aktivira) označite skupino identičnih točk na različnih etažah ter pritisnite tipko <I> na tipkovnici. Najlažje to storite tako, da držite levi miškin gumb, ter miško povlečete preko točk, ki predstavljajo isti vogal stavbe v različnih etažah ter nato pritisnete tipko <I>. Točke se odebelijo in obarvajo z enako barvo. Določiti morate 3 - 10 skupin identičnih točk. Če želite katero od točk odstraniti, točko izberite in pritisnite tipko <N> na tipkovnici. Spodnja slika prikazuje primer, ko so določene štiri skupine identičnih točk.
Za poravnavo nato kliknite na gumb Poravnaj izbrane etaže. Ukaz vsako posamezno etažo prilagodi na referenčno etažo, pri čemer uporabi afino transformacijo z izravnavo. Rezultat poravnave so optimalno poravnani etažni načrti. Po poravnavi pa lahko z orodjem Zlepi identične točke identične točke pripnete točno na položaj referenčne etaže.
Za oba ukaza deluje tudi funkcija Razveljavi .